主導該項目的波蘭科學院生物有機化學研究所教授Marek Figlerowicz對路透社表示，對波蘭遺傳數據安全的擔憂，源自美國國家人工智能安全委員會（NSCAI）今年早些時候的一份報告。該報告指，華大基因可能正在充當“中國（共）政府基因數據庫的全球收集機制”。
據Figlerowicz披露，波蘭“基因組圖譜”項目對5,000個波蘭基因組的測序已經進行了大約一半。自2019年起，測序工作外包給第三方——中歐基因組學中心（CEGC），該中心去年開始使用華大基因的技術。
Figlerowicz表示，隨著基因測序技術的進步和成本的降低，項目計劃將剩餘的測序工作引入內部，並決定不再將任何基因數據發送到波蘭境外，以確保波蘭基因組的“獨立性”和數據安全。
Figlerowicz說，可能會取消與中歐基因組學中心的合約，但最終決定仍需得到資助機構的批准，預計在未來一兩週內會有結果。
今年8月，波蘭科學院人類遺傳學委員會曾表示，某“遠東公司”“不遵守”基因檢測倫理原則的做法，令人產生嚴重懷疑。委員會沒有點名任何公司或國家，但敦促實驗室和科學機構停止把遺傳測序外判給該公司。
該委員會估計，大約100,000個完整的波蘭基因組可能已經在“遠東”實驗室中，而波蘭無法控制這些敏感的個人數據。
截至目前，中歐基因組學中心和歐盟以及波蘭參與資助該項目的機構都沒有對此作出評論。持有中歐基因組學中心少數股權的生物技術公司Inno-Gene S.A.則表示，不知道可能會取消合作。
今年7月，《路透社》發表調查報道指，北京華大基因在全球利用其產前檢測服務，收集超過800萬孕婦基因，並將所得成果與中共軍方共享，進行研究。
另外，早在今年1月，哥倫比亞廣播公司（CBS）節目披露，華大基因同中共軍方有密切聯繫，並打算在華盛頓、紐約和加州等地建立和營運實驗室。
美國安全部官員警告，中共或利用華大基因一類的的公司收集生物數據，威脅國家安全。
